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新任教師として美浜学園に赴任した有坂秋桜里。だがそこは法の隙間をついた執行機関の工作員を養成する、いわば殺し屋学園だった!!　血と硝煙の香りをまとう少女たちに秋桜里は困惑するが……!?

私立美浜学園で個性豊かな少女達と共同生活をする事になった風見雄二。穏やかな学生生活をおくっていく一方で、雄二は少女達の過去の秘密を知る事になる。そこから物語は動き始める。

TVアニメ化決定の大ヒットゲームコミカライズ！「今度こそ護ってみせる。この、灰色の果樹園を──」。異例の大ヒットを記録し、ＴＶアニメ化も決定した話題沸騰のゲーム「グリザイアの果実」を「BLOOD+」「攻殻機動隊」の藤咲淳一×新進気鋭作家・姫乃タカのタッグでコミカライズ！由美子視点で描かれる新たなるグリザイアの果実とは…!?

『グリザイアの果実』や『ファントムトリガー』のキャラクターも登場する話題作！アラタは美浜学園Ｄ組の伝習員として、将来国防を担うＳＯＲＤ戦闘員を目指す少女たちを指導している。美浜学園Ｄ組には個性的なメンバーが勢揃い！シリアスよりは笑い多め？Ｄ組のゆる～い日常をのぞいてみよう♪