高校入学を前に命を落としてしまった少年・一剛木。目を覚ますと、フルメタルボディの改造人間に!? 体を操縦するのは小さくなった幼なじみ・操! 二人は無事 青春を謳歌できるのか―…!? テンパりまくりな学園生活の歯車が動き出す!!!
来たる世界大戦に備えて、暗号解読に長けた少女達が集う軍人学校。その名も『暗号学園』!! そんな高校とは露知らずに入学してしまったいろは坂いろはは、ひょんなことから学園生活を懸けた暗号バトルに巻き込まれることに…。苦戦するいろはだが、その手にはあらゆる戦争を停められる鍵が握られていて…!? 十五の少女達が、銃後で暗号を解く!! 奇想天外な学園ミステリードラマ、開幕!!